Protein–RNA interactions for Protein: P02772

Afp, Alpha-fetoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfpP02772 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AfpP02772 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AfpP02772 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AfpP02772 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AfpP02772 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AfpP02772 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AfpP02772 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AfpP02772 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AfpP02772 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AfpP02772 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AfpP02772 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AfpP02772 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AfpP02772 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AfpP02772 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AfpP02772 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AfpP02772 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AfpP02772 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AfpP02772 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AfpP02772 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AfpP02772 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AfpP02772 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AfpP02772 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AfpP02772 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AfpP02772 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AfpP02772 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AfpP02772 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AfpP02772 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AfpP02772 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AfpP02772 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AfpP02772 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AfpP02772 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AfpP02772 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AfpP02772 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AfpP02772 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AfpP02772 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AfpP02772 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AfpP02772 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AfpP02772 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AfpP02772 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AfpP02772 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AfpP02772 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AfpP02772 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AfpP02772 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AfpP02772 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AfpP02772 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AfpP02772 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AfpP02772 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AfpP02772 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AfpP02772 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AfpP02772 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AfpP02772 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AfpP02772 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AfpP02772 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AfpP02772 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AfpP02772 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AfpP02772 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AfpP02772 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AfpP02772 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AfpP02772 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AfpP02772 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AfpP02772 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AfpP02772 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AfpP02772 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AfpP02772 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AfpP02772 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AfpP02772 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AfpP02772 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AfpP02772 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AfpP02772 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AfpP02772 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AfpP02772 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AfpP02772 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AfpP02772 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AfpP02772 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AfpP02772 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AfpP02772 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AfpP02772 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AfpP02772 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AfpP02772 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AfpP02772 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AfpP02772 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AfpP02772 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AfpP02772 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AfpP02772 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AfpP02772 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AfpP02772 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AfpP02772 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AfpP02772 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AfpP02772 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AfpP02772 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AfpP02772 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AfpP02772 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AfpP02772 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AfpP02772 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AfpP02772 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AfpP02772 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AfpP02772 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AfpP02772 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AfpP02772 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AfpP02772 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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