Protein–RNA interactions for Protein: P01887

B2m, Beta-2-microglobulin, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2mP01887 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B2mP01887 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B2mP01887 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B2mP01887 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B2mP01887 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B2mP01887 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B2mP01887 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B2mP01887 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B2mP01887 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B2mP01887 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B2mP01887 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B2mP01887 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B2mP01887 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B2mP01887 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B2mP01887 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B2mP01887 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B2mP01887 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B2mP01887 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B2mP01887 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B2mP01887 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B2mP01887 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B2mP01887 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B2mP01887 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B2mP01887 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B2mP01887 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B2mP01887 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B2mP01887 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B2mP01887 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B2mP01887 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B2mP01887 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B2mP01887 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B2mP01887 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B2mP01887 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B2mP01887 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B2mP01887 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B2mP01887 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B2mP01887 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B2mP01887 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B2mP01887 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B2mP01887 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B2mP01887 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B2mP01887 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B2mP01887 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B2mP01887 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B2mP01887 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B2mP01887 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
B2mP01887 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B2mP01887 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B2mP01887 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B2mP01887 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B2mP01887 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B2mP01887 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B2mP01887 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B2mP01887 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B2mP01887 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B2mP01887 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B2mP01887 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B2mP01887 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B2mP01887 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B2mP01887 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B2mP01887 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B2mP01887 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B2mP01887 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B2mP01887 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B2mP01887 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B2mP01887 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B2mP01887 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B2mP01887 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B2mP01887 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B2mP01887 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B2mP01887 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B2mP01887 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B2mP01887 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B2mP01887 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
B2mP01887 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B2mP01887 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B2mP01887 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B2mP01887 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B2mP01887 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B2mP01887 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B2mP01887 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B2mP01887 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B2mP01887 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B2mP01887 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B2mP01887 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B2mP01887 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B2mP01887 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B2mP01887 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B2mP01887 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B2mP01887 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B2mP01887 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B2mP01887 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B2mP01887 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B2mP01887 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B2mP01887 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B2mP01887 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B2mP01887 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B2mP01887 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B2mP01887 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B2mP01887 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms