Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
P01725 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01725 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01725 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01725 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01725 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01725 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01725 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01725 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01725 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01725 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01725 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01725 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P01725 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01725 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01725 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01725 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01725 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01725 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01725 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01725 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01725 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01725 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01725 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01725 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01725 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01725 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01725 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01725 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01725 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01725 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01725 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01725 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01725 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01725 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01725 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01725 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01725 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01725 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01725 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01725 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01725 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01725 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01725 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P01725 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01725 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01725 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01725 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01725 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01725 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01725 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01725 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01725 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01725 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01725 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01725 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01725 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01725 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01725 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01725 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01725 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01725 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01725 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01725 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01725 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01725 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01725 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01725 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01725 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01725 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01725 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01725 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01725 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P01725 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01725 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01725 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01725 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01725 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01725 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01725 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01725 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01725 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01725 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P01725 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P01725 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
P01725 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P01725 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01725 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01725 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01725 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01725 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01725 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01725 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01725 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01725 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01725 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01725 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01725 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01725 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01725 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms