Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01655 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01655 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01655 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01655 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01655 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01655 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01655 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01655 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01655 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01655 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01655 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01655 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01655 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01655 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01655 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01655 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01655 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01655 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01655 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01655 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01655 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
P01655 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01655 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01655 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01655 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01655 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01655 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01655 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01655 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01655 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01655 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01655 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01655 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01655 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01655 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01655 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01655 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01655 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01655 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01655 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01655 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01655 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01655 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01655 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01655 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01655 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01655 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
P01655 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
P01655 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01655 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01655 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01655 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01655 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01655 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01655 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01655 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01655 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01655 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01655 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01655 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01655 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01655 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01655 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
P01655 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01655 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01655 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01655 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01655 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01655 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01655 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01655 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01655 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01655 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01655 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01655 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01655 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01655 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01655 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01655 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01655 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01655 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01655 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01655 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01655 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01655 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01655 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01655 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01655 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01655 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01655 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01655 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01655 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01655 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01655 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01655 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01655 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01655 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
P01655 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01655 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms