Protein–RNA interactions for Protein: O88809

Dcx, Neuronal migration protein doublecortin, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcxO88809 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DcxO88809 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DcxO88809 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DcxO88809 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DcxO88809 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DcxO88809 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DcxO88809 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DcxO88809 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DcxO88809 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DcxO88809 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DcxO88809 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DcxO88809 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DcxO88809 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DcxO88809 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DcxO88809 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DcxO88809 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DcxO88809 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DcxO88809 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DcxO88809 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DcxO88809 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DcxO88809 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DcxO88809 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DcxO88809 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DcxO88809 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DcxO88809 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DcxO88809 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DcxO88809 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DcxO88809 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DcxO88809 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DcxO88809 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DcxO88809 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DcxO88809 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DcxO88809 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DcxO88809 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DcxO88809 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DcxO88809 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DcxO88809 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DcxO88809 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DcxO88809 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DcxO88809 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DcxO88809 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DcxO88809 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DcxO88809 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DcxO88809 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DcxO88809 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DcxO88809 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DcxO88809 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DcxO88809 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DcxO88809 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DcxO88809 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DcxO88809 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DcxO88809 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DcxO88809 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DcxO88809 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DcxO88809 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DcxO88809 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DcxO88809 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DcxO88809 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DcxO88809 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DcxO88809 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DcxO88809 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DcxO88809 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DcxO88809 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DcxO88809 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DcxO88809 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DcxO88809 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DcxO88809 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DcxO88809 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DcxO88809 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DcxO88809 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DcxO88809 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DcxO88809 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DcxO88809 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DcxO88809 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DcxO88809 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DcxO88809 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DcxO88809 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DcxO88809 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DcxO88809 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DcxO88809 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DcxO88809 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DcxO88809 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DcxO88809 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DcxO88809 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DcxO88809 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DcxO88809 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DcxO88809 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DcxO88809 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DcxO88809 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DcxO88809 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DcxO88809 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DcxO88809 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DcxO88809 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DcxO88809 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DcxO88809 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DcxO88809 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DcxO88809 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DcxO88809 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DcxO88809 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DcxO88809 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.5 ms