Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
BlmO88700 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
BlmO88700 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
BlmO88700 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
BlmO88700 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
BlmO88700 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
BlmO88700 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
BlmO88700 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
BlmO88700 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
BlmO88700 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
BlmO88700 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
BlmO88700 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
BlmO88700 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
BlmO88700 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
BlmO88700 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
BlmO88700 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
BlmO88700 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
BlmO88700 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
BlmO88700 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
BlmO88700 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
BlmO88700 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
BlmO88700 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
BlmO88700 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
BlmO88700 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
BlmO88700 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
BlmO88700 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
BlmO88700 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
BlmO88700 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
BlmO88700 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
BlmO88700 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
BlmO88700 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
BlmO88700 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
BlmO88700 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
BlmO88700 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
BlmO88700 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
BlmO88700 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
BlmO88700 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
BlmO88700 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
BlmO88700 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
BlmO88700 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
BlmO88700 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
BlmO88700 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
BlmO88700 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
BlmO88700 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
BlmO88700 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
BlmO88700 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
BlmO88700 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
BlmO88700 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
BlmO88700 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
BlmO88700 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
BlmO88700 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
BlmO88700 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
BlmO88700 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
BlmO88700 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
BlmO88700 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
BlmO88700 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
BlmO88700 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
BlmO88700 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
BlmO88700 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
BlmO88700 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
BlmO88700 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
BlmO88700 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
BlmO88700 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
BlmO88700 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
BlmO88700 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
BlmO88700 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
BlmO88700 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
BlmO88700 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
BlmO88700 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
BlmO88700 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
BlmO88700 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
BlmO88700 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
BlmO88700 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
BlmO88700 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
BlmO88700 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
BlmO88700 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
BlmO88700 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
BlmO88700 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
BlmO88700 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
BlmO88700 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
BlmO88700 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
BlmO88700 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
BlmO88700 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
BlmO88700 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
BlmO88700 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
BlmO88700 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
BlmO88700 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
BlmO88700 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
BlmO88700 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
BlmO88700 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
BlmO88700 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
BlmO88700 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
BlmO88700 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
BlmO88700 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
BlmO88700 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
BlmO88700 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
BlmO88700 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
BlmO88700 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
BlmO88700 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
BlmO88700 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms