Protein–RNA interactions for Protein: O54834

Arhgap6, Rho GTPase-activating protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap6O54834 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap6O54834 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap6O54834 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap6O54834 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap6O54834 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap6O54834 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap6O54834 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgap6O54834 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgap6O54834 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgap6O54834 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgap6O54834 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgap6O54834 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgap6O54834 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgap6O54834 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgap6O54834 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgap6O54834 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Arhgap6O54834 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap6O54834 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms