Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vwa3bJ9JI28 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms