Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21900J3QP38 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms