Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mfsd4b4J3QNS5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms