Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm17535J3KMR8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm17535J3KMR8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm17535J3KMR8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm17535J3KMR8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm17535J3KMR8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm17535J3KMR8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm17535J3KMR8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm17535J3KMR8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm17535J3KMR8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm17535J3KMR8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm17535J3KMR8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm17535J3KMR8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm17535J3KMR8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm17535J3KMR8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm17535J3KMR8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm17535J3KMR8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm17535J3KMR8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm17535J3KMR8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm17535J3KMR8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm17535J3KMR8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm17535J3KMR8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms