Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Rfx7F8VPJ6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rfx7F8VPJ6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms