Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3443F7CCV5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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