Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21977F6U3N7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21977F6U3N7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms