Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610001J05RikF2Z3Y9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610001J05RikF2Z3Y9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms