Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm20518E9Q548 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms