Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms