Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aldh3b2E9Q3E1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms