Protein–RNA interactions for Protein: E9PVR6

Vmn1r1, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r1E9PVR6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r1E9PVR6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms