Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prrt2E9PUL5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms