Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6L3

Vmn2r49, Vomeronasal 2, receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r49D3Z6L3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn2r49D3Z6L3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn2r49D3Z6L3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn2r49D3Z6L3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn2r49D3Z6L3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn2r49D3Z6L3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn2r49D3Z6L3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn2r49D3Z6L3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn2r49D3Z6L3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn2r49D3Z6L3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn2r49D3Z6L3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r49D3Z6L3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r49D3Z6L3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms