Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

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Length 762 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf1D3YY23 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lonrf1D3YY23 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lonrf1D3YY23 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lonrf1D3YY23 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lonrf1D3YY23 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Lonrf1D3YY23 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lonrf1D3YY23 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Lonrf1D3YY23 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lonrf1D3YY23 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lonrf1D3YY23 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lonrf1D3YY23 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Lonrf1D3YY23 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lonrf1D3YY23 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lonrf1D3YY23 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lonrf1D3YY23 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lonrf1D3YY23 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lonrf1D3YY23 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lonrf1D3YY23 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lonrf1D3YY23 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Lonrf1D3YY23 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms