Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc13D3YV10 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms