Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otud4B2RRE7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otud4B2RRE7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms