Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brpf1B2RRD7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brpf1B2RRD7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms