Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf3B2KF05 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 248.3 ms