Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prr29B1ARI9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prr29B1ARI9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms