Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms