Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint4A7TZF3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint4A7TZF3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms