Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ38

Gm13941, Predicted gene 13941 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13941A2AJ38 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13941A2AJ38 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13941A2AJ38 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13941A2AJ38 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13941A2AJ38 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13941A2AJ38 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm13941A2AJ38 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm13941A2AJ38 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms