Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc27A2A6Q5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc27A2A6Q5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc27A2A6Q5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc27A2A6Q5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc27A2A6Q5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc27A2A6Q5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms