Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GST9

Ctxnd1, Cortexin domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxnd1A0A1B0GST9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctxnd1A0A1B0GST9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctxnd1A0A1B0GST9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctxnd1A0A1B0GST9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctxnd1A0A1B0GST9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms