Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH6

1520401A03Rik, RIKEN cDNA 1520401A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms