Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRF5

Gm20792, Predicted gene 28891, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20792A0A087WRF5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20792A0A087WRF5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms