Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUF1

Vmn1r49, Vomeronasal type-1 receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r49Q9WUF1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r49Q9WUF1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r49Q9WUF1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r49Q9WUF1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r49Q9WUF1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r49Q9WUF1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r49Q9WUF1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r49Q9WUF1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r49Q9WUF1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r49Q9WUF1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r49Q9WUF1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r49Q9WUF1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r49Q9WUF1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Vmn1r49Q9WUF1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r49Q9WUF1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms