Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Gpc1Q9QZF2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Gpc1Q9QZF2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpc1Q9QZF2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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