Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Six6Q9QZ28 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Six6Q9QZ28 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms