Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SpastQ9QYY8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SpastQ9QYY8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms