Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms