Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cml5Q9QXS8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms