Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm4Q9QXA5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm4Q9QXA5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.5 ms