Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dkk3Q9QUN9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms