Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB8

Cntn6, Contactin-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn6Q9JMB8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntn6Q9JMB8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn6Q9JMB8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms