Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gkap1Q9JMB0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gkap1Q9JMB0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms