Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col5a3Q9JLI2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms