Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgn5Q9JL35 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms