Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lmx1aQ9JKU8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmx1aQ9JKU8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms