Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpa33Q9JKA5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpa33Q9JKA5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpa33Q9JKA5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpa33Q9JKA5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpa33Q9JKA5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpa33Q9JKA5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms