Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Bco1Q9JJS6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Bco1Q9JJS6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bco1Q9JJS6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Bco1Q9JJS6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Bco1Q9JJS6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Bco1Q9JJS6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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