Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Riox1Q9JJF3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms