Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Cldn19Q9ET38 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Cldn19Q9ET38 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Cldn19Q9ET38 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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Cldn19Q9ET38 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn19Q9ET38 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Cldn19Q9ET38 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn19Q9ET38 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Cldn19Q9ET38 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn19Q9ET38 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn19Q9ET38 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn19Q9ET38 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn19Q9ET38 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Cldn19Q9ET38 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn19Q9ET38 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn19Q9ET38 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Cldn19Q9ET38 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn19Q9ET38 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn19Q9ET38 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn19Q9ET38 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn19Q9ET38 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn19Q9ET38 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn19Q9ET38 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn19Q9ET38 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn19Q9ET38 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn19Q9ET38 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn19Q9ET38 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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