Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG2

Strn3, Striatin-3, mousemouse

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Length 796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn3Q9ERG2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strn3Q9ERG2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Strn3Q9ERG2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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